Евгений Нагорный женат на дочери Путина Марии Воронцовой, враче-эндокринологе.
Во время войны Нагорный путешествует за границу. В частности, он был в Дубае. Ранее они вместе с Воронцовой часто летали в страны Европы, но теперь дочь Путина находится под санкциями ЕС.