Один из сотрудников института в ходе следствия рассказал, что в день пожара он обратил внимание на несколько странностей. По его словам, около 9:30 утра 21 апреля (примерно за час до начала пожара) над внутренним двором института завис квадрокоптер. «Погода была очень ветреная, и человек обычно не стал бы запускать квадрокоптер», — говорится в показаниях свидетеля.
По официальной версии, пожар произошел из-за того, что начальник отдела военно-научной информации ЦНИИ, подполковник запаса Сергей Васкецов, оставил включенным кипятильник в пластиковой кружке в своём кабинете.
После того как он выпил по рюмке коньяка с представителем Главного управления инновационного развития Минобороны Коледой, Васкецов отправился проводить для него экскурсию по институту перед началом Дня инноваций, который должен был пройти в ЦНИИ 21 апреля 2022 года. За причинение смерти по неосторожности двум или более лицам Васкецов получил два года условно с испытательным сроком два года.
Уголовное дело в отношении бывшего начальника института, полковника Дмитрия Дмитровича, было выделено в отдельное производство. На данный момент расследование приостановлено.